Si la sclérose en plaques (SEP) n'est pas un facteur de risque de Covid en soi, les corticoïdes à forte dose utilisés pour les poussées sont associés à des formes plus graves de l'infection, de même qu'un traitement de fond par anti-CD20 (rituximab, ocrélizumab). Pour les autres traitements de fond, l'effet semble à l'inverse plutôt protecteur.
Les anti-CD20 posent aussi problème pour la vaccination anti-Covid via un effet sur les lymphocytes B. La vaccination est moins efficace, voire nulle, si elle est réalisée peu de temps après la perfusion d'anti-CD20, qui est administrée tous les six mois. Il est préconisé d'attendre au moins quatre mois par rapport à la dernière perfusion pour administrer le vaccin et trois doses sont nécessaires pour la primovaccination. L'objectif est d'intercaler, entre les perfusions, les trois doses et la quatrième de rappel (dès trois mois après la troisième dose).
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