La société européenne de gastroentérologie, d'hépatologie et de nutrition pédiatrique (ESPGHAN) a réalisé une évaluation assortie de recommandations sur l'utilisation des probiotiques en prévention des diarrhées liées aux antibiottiques. Ce type de diarrhées peut survenir quelques jours voire quelques mois après l'arrêt d'une antibiothérapie. Souvent modérée - aucun pathogène n'est retrouvé -, elle peut prendre la forme d'une colite pseudomembraneuse à Clostridium difficile.
Dans la lignée de ses recommandations de 2014 sur les diarrhées aiguës, le comité a réalisé une méta-analyse des études sur le sujet. Celle-ci conclut que les probiotiques dans leur ensemble sont « efficaces » en prévention des diarrhées associées aux antibiotiques. Deux souches font l'objet d'une forte recommandation : Lactobacillus rhamnosus (LGG) et Saccharomyces boulardii. En revanche, seule S. Bourlardii fait l'objet d'une recommandation (grade faible) en prévention de C. difficile. « Si l'objectif visé est de prévenir les diarrhées liées à C. difficile, le comité suggère l'utilisation de S. boulardii », est-il précisé. En 2014, l’évaluation de ESPGHAN avait conclu à une recommandation forte pour Lactobacillus rhamnosus et Saccharomyces boulardii dans la gastro-entérite (réduction de la durée et des symptômes).
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