La biopsie liquide se déploie en France

En France, l’institut Gustave-Roussy a ouvert depuis juillet, en partenariat avec Roche, le laboratoire de biopsie liquide Fresh. Avec une exclusivité pour le test de profilage génomique du géant pharmaceutique suisse, Gustave-Roussy dote l’ensemble du territoire français, outre-mer compris, d’une capacité d’analyse de 4 000 à 8 000 tests par an. Plusieurs centaines d’échantillons ont été analysées depuis cet été, issues des centres d’Unicancer et des CHU qui ont rejoint le programme.

Jusque-là, le profilage génomique par biopsie liquide était délocalisé en Allemagne, l’une des rares plateformes certifiées en Europe (désormais au nombre de trois avec Fresh). La création d’un centre français contribue à la souveraineté sanitaire du pays et offre un gain de temps significatif pour l’obtention des résultats. Le Pr Fabrice Barlesi, directeur général de Gustave-Roussy, se félicite : « L’ouverture de Fresh s’inscrit dans notre mission de rendre la médecine de précision accessible au plus grand nombre. Il y a un enjeu d’équité d’accès à la médecine de précision sur l’ensemble du territoire, auquel nous souhaitons répondre ».

À partir d’une prise de sang, cette biopsie non invasive effectue le profil génétique d’une tumeur en analysant l’ADN tumoral circulant, grâce au Next Generation Sequencing. Les avantages sont multiples : la technique offre une vision globale des sites tumoraux et de leur hétérogénéité ; son taux d’échec technique est de 3,9 % contre 15 % pour une biopsie solide ; et l’analyse est obtenue en 12 jours contre 46. L’examen bénéficie considérablement aux patients métastatiques, mais aussi aux personnes avec des contre-indications à la biopsie solide ou avec une tumeur inaccessible.

L’accès collaboratif à Fresh facilitera l’ouverture d’études cliniques précoces dans de petits centres et l’orientation d’un patient vers l’essai le plus adapté à son profil génomique. De plus, à mesure que la base de données s’enrichira, les algorithmes d’intelligence artificielle auront de quoi s’entraîner pour découvrir des moyens d’action thérapeutique ou d’aide au diagnostic et au pronostic. « L’enjeu est de générer une quantité de données extrêmement importante. Pour travailler sur l’ADN circulant, il faut descendre à des sensibilités de l’ordre de 0,01 % » indique Pierre Mezeray, directeur transformation en santé et solutions diagnostiques chez Roche.

Vers une utilisation en dépistage de routine ?

Dans son usage autorisé à date, le profilage génétique tumoral par biopsie liquide se limite au choix de la stratégie thérapeutique mais ses indications ont vocation à s’étendre. Le diagnostic précoce et le monitoring sont les prochaines étapes. Dans la surveillance de la maladie résiduelle, la biopsie liquide permettrait une désescalade thérapeutique en identifiant les patients vraisemblablement guéris.

À plus long terme, une biopsie liquide « de routine » lors d’un bilan sanguin annuel pourrait être envisagée. « La société demande à pouvoir identifier un risque de cancer et le modifier pour ne jamais être malade. C’est le domaine de l’interception. », explique le Pr Barlesi. Son ambition pour l’institut ? « Être les découvreurs de l’équivalent du cholestérol pour dépister le cancer », que cela vienne de la biopsie liquide ou d’une autre technologie.